قصة الفيلم
يعيد فريق Joes الفريق لمنع كوبرا من تحقيق الهيمنة الكاملة على العالم في هذا الجزء الثاني الذي يبدأ بعد وقت قصير من أحداث GI Joe: The Rise of Cobra. تم تحييد تهديد النانوميت، وسجنت حكومة الولايات المتحدة قائد الكوبرا وديسترو في سجن تحت الأرض لا مفر منه.عندما يتم اغتيال زعيم باكستان، يدعو الرئيس الأمريكي (جوناثان برايس) عائلة جو لتأمين الرؤوس الحربية النووية الباكستانية قبل أن تقع في أيدي العدو.ولكن في أعقاب إكمال مهمتهم بنجاح، يتم القضاء على فريق Joes في هجوم مفاجئ مدمر، وعندما ينقشع الدخان، يكون الناجون الوحيدون هم Roadblock (دواين جونسون) والليدي جاي (أدريان باليكي) وفلينت (دي جي كوترونا)، وهم مقتنعون بوجود خطأ ما في البيت الأبيض. House، وكما تفترض الليدي جاي أن المحتال يتظاهر بأنه القائد الأعلى، يتعاون الأشرار ستورم شادو (لي بيونج هون) وفايرفلاي (راي ستيفنسون) لإخراج قائد الكوبرا (لوك براسي) من السجن. لاحقًا، بينما يتراجع Storm Shadow إلى الجبال للتعافي من الحروق التي لحقت به أثناء عملية الاستخراج، يتمكن Snake Eyes (Ray Park) وJinx (Elodie Yung) من القبض على النينجا الأبيض المراوغ، وفي هذه العملية يكتشفان سرًا صادمًا عن ماضيه وتعلمه. أن زارتان (أرنولد فوسلو)، الذي تظاهر بأنه الرئيس، دعا إلى قمة دولية لمناقشة نزع السلاح النووي من أجل جعل زعماء العالم يركعون أمام قائد الكوبرا الشيطاني. الآن، بينما تحتجز كوبرا الكرة الأرضية بأكملها كرهينة بسلاح ثوري جديد يتم وضعه على الأقمار الصناعية التي تدور حول الكوكب، فإن الأمر متروك لـ Joes وصديق قديم جدير بالثقة لإنقاذ اليوم.